Pesantren sebagai sebuah model pendidikan yang khas Islam Indonesia dimana didalamnya terlibat satu sistem keterkaitan antara kiai, masyarakat, masjid dan santri telah melalui perjalanan panjang bersamaan dengan terbentuknya masyarakat Indonesia.Dalam rentang waktu yang panjang tersebut dan berbagai dinamika yang terjadi pada Bangsa Indonesia terbukti pesantren mampu menyumbangkan sesuatu yang besar bagi perjalanan bangsa.Kesederhanaan, kejuangan, kemandirian, kebersamaan dan keikhlasan yang menjadi jiwa dari setiap gerak langkah pendidikan di pesantren telah terbukti mampu menghasilkan sumberdaya yang bisa menjadi penggerak dan memiliki akseptabilitas yang tinggi di masyarakat .
Pesantren menjadi diterima di semua lapisan masyarakat : pedesaan, perkotaan, nelayan, petani, pedagang, pegawai dan semua strata masyarakat tentunya tidak berjalan begitu saja tanpa sebuah sebab yang mendasar. Akar dari akseptabilitas itu adalah adanya prinsip-prinsip tasammuh, tawassuth dan i'tidal yang selalu dikedepankan dalam menjalankan dan menyampaikan ajaran agama menjadikan pesantren bisa diterima oleh semua golongan.
Tradisi ke Islaman yang telah dikembangkan di pesantren dan jiwa pesantren sebagai ciri khas pendidikan pesantren inilah yang ingin tetap dikembangkan di Ma'had Aly Al Hikam untuk mampu menjawab kebutuhan masyarakat. Kebutuhan akan pencerahan pengetahuan Islam, kebutuhan akan terselenggaranya praktik kehidupan yang tetap dilandasi nilai keagamaan, kebutuhan akan adanya harmoni dalam orientasi – orientasi kehidupan dalam kondisi masyarakat saat ini yang semakin pragmatis dan kering dari nilai-nilai spiritual.
Akan tetapi kebutuhan masyarakat saat ini terlebih lagi dalam konteks masyarakat modern membutuhkan prasyarat sehingga informasi, pengetahuan, pemahaman yang akan ditawarkan bisa diterima. Salah satu prasyarat itu adalah metode (thariqah) yang sesuai dengan karakter masyarakat Modern sehingga esensi (maddah) dari ajaran Islam bisa disampaikan secara tepat menurut konteks masyarakat saat ini.
Menjadi harapan dari semua upaya ini adalah selalu tersedianya sumberdaya yang memiliki pengetahuan Keislaman yang mendalam, mampu menyampaikannya menurut konteks masyarakat dimana mereka berada dengan tetap berpegang kepada kearifan budaya dimana dia dilahirkan dan dibesarkan, Budaya Indonesia.
Visi :
Visi Ma'had Aly Al Hikam adalah sebagai berikut. Menjadi lembaga pendidikan rujukan dalam pengembangan keilmuan keislaman, pengembangan lembaga (pesantren) dan dakwah multi kultural. Oleh karena itu, dalam setiap gerak dan kegiatannya, Ma'had Aly Al Hikam senantiasa melakukan inovasi, interpretasi, dan reinterpretasi, serta mengambil inisiatif terhadap pengelolaan perubahan.
Misi :
Misi yang diemban oleh Ma'had Aly Al Hikam adalah sebagai berikut:
Mengembangkan pesantren secara keilmuan maupun secara kelembagaan dan melakukan pencerahan kepada masyarakat melalui kegiatan ta'lim, tarbiyah, ta'dib, dan irsyad dengan menumbuhkembangkan sikap dan perilaku inovatif, kreatif, dan reinterpretatif, serta kecakapan untuk mengelola perubahan.
Meningkatkan kompetensi lulusan pesantren melalui pembekalan dan penguatan di bidang ilmu alat, yakni bahasa dan perangkat metodologi berpikir ilmiah, serta pengembangan wawasan.
